J'ai aussi ce problème de "remise en route" quand j'ai laissé une partie trop longtemps. Et généralement je recommence une partie aussi.
Mais quoiqu'il arrive, je reste assez anarchique dans mes constructions : j'en mets dans tous les sens, je mets des bâtiments en plus un peu à l'arrache...
J'ai trouvé une bonne parade pour faciliter les choses : si je peux, c'est une ile par type de production. Et je renomme les iles avec cette production (par exemple l'ile "sushi", l'ile "puces et cuivre"...). Ca marche bien. Problème, en début de partie ça coûte cher, puisque ça augmente d'autant les routes commerciales, et donc les bateaux à avoir.
De même avec les bateaux : je les renomme systématiquement avec le nom de leur route commerciale. Je sais donc tout de suite où ils vont.
Un exemple : j'ai les iles "Sushi" "Thé" et l'ile principale "Patelin".
La route commerciale s'appellera "Sus - the" et le bateau qui fera la route s'appellera aussi "Sus - the". D'un coup d'oeil j'ai tout ensemble.