Ça doit être possible d'encrypter en NTFS sur un Windows Pro et ensuite exporter puis importer le cerficat (format .pfx) qui va avec sur tes deux PC. Je le fais avec mes PC sous 7 Pro et feu XP.
Attention toutefois, ça empêche la lecture et l'exécution mais pas la navigation de l'arborescence.
Veracrypt comme mentionné au dessus te permettra une plus grande confidentialité avec son système de container. Et c'est multiplateforme.
Bitlocker je ne sais pas si ça permet une exportation des clés, et donc une utilisation sur plusieurs machines ?